如果男性确诊为衣原体感染，需要及时进行治疗。
患病后，男性应该及时遵医嘱使用抗菌药物进行治疗，可以选择阿奇霉素、左氧氟沙星、罗红霉素等敏感药物进行药物处理。男性的衣原体感染以非淋菌性尿道炎为主，会引起尿道灼热、疼痛、尿道瘙痒、尿道口有异样的脓性分泌物、有异味等症状。
另外，这种疾病是通过性接触传染的，因此在治疗过程中要尽量不要有性行为。