染性软疣完全愈合后不复发，由于人体发病以后，体内存在抗体，很少复发。
如果病人治疗后又反复发作，那么就有可能之前生病的时候没有完全治好，病毒也存在于身体中，停药一段时间后，病毒又会不断地在身体里滋生，继而出现显示传染性软疣的症状。
同时由于传染性软疣病毒能够自体接种，病人若继续用先前使用过的未被消毒的东西，可能再次感染传染性软疣病毒。