目前孕妇支原体感染后主要应用大环内酯类，包括红霉素、罗红霉素、阿奇霉素和克拉霉素。
治疗结束后3周内仍有死的病原持续排出，故临床上采用非培养方法检测仍可能为阳性，应在停止治疗3周后复查。对于感染造成的并发症也要进行正规有效的治疗，性伴侣也要同时接受治疗。为及时发现是否有支原体感染，.婚前以及初次产前保健时应进行常规检测，有反复流产或早产史的患者可进行支原体亚型检查和治疗。