目前输卵阻塞尚缺乏有效的药物治疗。若患者存在炎症，医生可根据药敏试验结果采用相应的抗生素进行治疗，如慢性输卵管炎可使用头孢替坦等头孢菌素类药物。
确诊输卵管堵塞后，根据患者输卵管堵塞的程度或位置的不同，采取相应的方案进行治疗。一般不选择药物治疗，主要是进行手术干预。对于有生育要求的患者可行辅助生殖技术。