衣原体感染选择四环素、红霉素、多西环素、阿奇霉素等药物。
衣原体肺炎、沙眼衣原体、肺炎衣原体、沙眼衣原体等都会导致衣原体肺炎、沙眼、尿道炎等。对四环素类、大环内酯类、喹诺酮类和四环素类抗生素、喹诺酮类抗生素等，对磺胺类、β-内酰胺类及氨基糖甙类抗生素有一定的抗性。可以选择四环素，红霉素，多西环素，阿奇霉素，克拉霉素。沙眼的临床表现为：四环素类、大环内酯类、氟喹诺酮类、青霉素类等，对沙眼可进行外用0.1%利福平、15%磺胺乙酰钠滴眼液进行局部注射。