肺炎衣原体感染是由支原体感染引起、环境因素与疾病因素。
如果支原体感染在呼吸道粘膜的表面黏液纤毛层中传播，毒性代谢产物能使人的纤毛运动渐趋衰弱，破坏人的肺细胞。肺炎衣原体的感染亦与环境因素有密切关系。若个体长时间待在空间狭小或者空气污染较重，极易引起体内肺炎衣原体的感染。营养不良、贫血等疾病也可能会导致衣原体感染。