男性衣原体阳性一般提示男性出现了衣原体感染，可以选用敏感的抗生素进行治疗。
男性可以口服用药常用药物有几种，一种是大环内酯类抗生素，如阿奇霉素、克拉霉素等也可以口服左氧氟沙星、环丙沙星等喹诺酮类抗生素进行治疗。
用药期间，男性应该避免饮酒，以免酒精与药物发生相互作用，产生不良反应。