男性感染了HPV后，早期可能没有任何的症状，有的男性会有阴茎疼痛、性交痛等症状，随着病情的发展，会有一定的临床症状，比如扁平疣、丘疹等。
HPV感染后的早期症状有烧灼痛、性交不适、有异物感。中后期感染HPV后会出现扁平疣或者是丘疹，如果是高风险HPV，就会出现尖锐湿疣，甚至会出现阴茎癌的症状。