衣原体感染后，患者可以在医生的指导下吃红霉素、罗红霉素、多西环素、米诺环素、阿奇霉素、克拉霉素等，这些抗生素对支原体和衣原体都是有效的。
不推荐使用头孢菌素、喹诺酮类的抗感染药物，这些药物对支原体、衣原体的治疗效果都不是很好。支原体、衣原体感染需要服用7-10天的药物来治疗。