导致生殖道感染主要病原体有很多，包括细菌、病毒、支原体等。
导致生殖道感染的致病菌有淋球菌、结核杆菌、病毒、支原体等，还有非特异性致病菌，如沙眼衣原体、滴虫等，其中支原体、衣原体所致生殖道感染最多。
生殖道感染不只是性传播的，还可能来自不干净的经期卫生、阴道内异物的刺激、不恰当的人工流产及分娩技术等。