根据导致生殖器感染的病因不同，使用的药物有所区别。
若生殖器感染为细菌感染，推荐使用莫匹罗星软膏、复方多粘菌素B型软膏、红霉素软膏等药膏治疗。若生殖器感染为真菌感染所致，推荐使用硝酸咪康唑乳膏、曲安奈德益康唑乳膏等抗真菌药膏治疗。
如果临床症状比较严重，可能需要配合口服药物治疗。