支原体感染由于发生的部位不同，症状有所不同。
1.呼吸道感染：如果发生在呼吸道，主要表现为发热、乏力、头痛、咳嗽咳痰、痰液呈粘性状，伴有咽痛、肌肉酸痛等，严重时会出现呼吸困难、喘憋等。
2.泌尿生殖道感染：如果发生在泌尿生殖道，主要表现为尿道口轻微的红肿、尿道刺痛、尿急、尿频等，少部分还会出现腰痛、双股内侧不适感等。