病毒感染的时间长短与病毒的种类、感染的部位、严重程度、是否进行了有效的治疗、个人的不同等因素有关。一些病毒性疾病的病程是自限性的，比如一般的感冒1-2周就会自行痊愈，只有少部分症状较重的病人会持续2个星期以上。
而出疹性病毒感染则是水痘、麻疹、手足口病等，通常会持续1~3天，10天左右即可自愈。但也有一些病毒很难根除，会转变成乙型肝炎、艾滋病等慢性传染病。