传染性软疣的治疗方法主要有物理治疗和药物治疗两种。
1.物理治疗：传染性软疣可以通过消毒，用钳子、挂疣的器具夹出软疣内的内容物，然后用碘伏消毒，或者压迫出血。单独的疣体，经过消毒处理，可以完全消除症状，定期复查。这是一种具有一定传染性的疾病，在治愈之前不要与他人接触。
2.药物治疗：西多福韦软膏可以涂于患处，但并非所有人都可以使用，应根据专业医师的处方使用。酞丁安软膏对传染性软疣有一定的治疗作用，但也有少部分患者会出现皮肤丘疹、皮肤红斑、皮肤刺痒等不良反应。
传染性软疣要及时治疗，在治疗过程中要对各种衣物器具进行消毒，避免与他人接触造成传播感染。