一般情况下，治疗传染性软疣病常用软膏进行治疗。
建议患者在医生的指导下，使用以抗病毒药物为主的外用药，如维A酸霜、氢氧化钾溶液、硝酸银软膏、鬼臼毒素霜、斑蛰素、咪喹莫特等药物。
另外，患者还可以采用液氮冷冻方式进行治疗，液氮冷冻创伤比较小，对于多发患者是比较方便的治疗方法。