一般情况下，想治疗阴囊感染性软疣，通常会刮除疣或用金属镊子直接拔除疣。
不够需要注意的是，在去除或刮除疣之前，必须进行消毒。同时也可以使用一些消炎软膏，比如红霉素软膏可以防止继发性细菌感染。
如果患者有明显的疼痛，可以选择物理方法进行治疗，比如冷冻。