衣原体感染是不会自行痊愈的。
衣原体是一种持久、隐蔽的疾病，对人体的组织会产生长期的病理损害。衣原体主要有肺炎衣原体、沙眼衣原体等。肺炎衣原体是可以通过气道飞沫传染的，进入肺部后，会附着在易感的宿主细胞上，从而导致支原体肺炎的发生，不及时处理，会导致肺炎的病情恶化。但多数患者在接受治疗后均能痊愈，并且有较好的预后。沙眼衣原体是通过手、眼、性接触传播的，会附着在眼睛、生殖器等地方，引起结膜炎、泌尿生殖系统感染。沙眼衣原体感染可以通过及时的治疗来治愈，但是如果不及时的治疗，或者不及时的治疗，会变成慢性的。
如果出现了衣原体感染，要立即进行治疗。