非淋菌性尿道炎是不能够自愈的，一旦出现非淋菌性尿道炎的话，建议采取积极治疗措施，避免病程迁延难愈。
若真的确诊为非淋菌性尿道炎，建议患者多饮水，提高抵抗力，遵医嘱服用抗生素，对于改善症状，清除尿液中白细胞可发挥较迅速作用、更加有效地发挥作用。若不治尿道炎可恶化，也许需要加大用药剂量，延长给药时间，还是需要增加恢复时间。