阴囊扁平疣一般能自愈。
这种病是一种具有自我修复能力的病毒性疾病。如果具有较高的免疫力，且病毒数目较少或毒性较弱，则有一定的自愈率。但也有复发的可能，在经过一些特殊的治疗后，病人的免疫力会降低，病毒的数量会增加，毒性也会增加，所以复发的几率很大。
阴囊扁平疣属于病毒感染，如果是在发育阶段，一不小心就会出现更多的情况，一开始是一两个，然后是整张脸，再是手背、手臂，乃至整个身体。