支原体通常是飞沫传播和性传播导致感染。
致病支原体中，肺炎支原体可引起肺炎，人型支原体，解脲支原体和生殖器支原体主要引起泌尿生殖道感染。支原体肺炎主要通过飞沫传播，生殖器支原体感染成人主要通过性接触传播，新生儿会通过母亲生殖道分娩时出现感染的情况。成人男性的感染部位在尿道黏膜，女性感染部位在宫颈部位。