目前常用的治疗HPV药物有生物蛋白辅料多克隆抗体、干扰素栓、瑞琳他抗、保妇康栓剂等。
HPV病毒感染后要特别注意，不能盲目的使用抗病毒的药物，要结合自身的实际情况，如果只是一次性感染，本身体质和免疫力都很强，可以不用任何药物和药物来治疗。还可以在医生的指导下服用一些抗病毒的药物。
还有一些情况，单纯服用药物并不能起到很好的作用，可以结合冷冻、激光等进行治疗。