激光去疣一般是应用二氧化碳光束，经过高温处理的方式，灼烧疣体达到破坏疣体的作用，如果激光去疣没有使用麻药，则会产生疼痛感。因此在激光去疣时，通常会在患者的局部皮肤涂抹复方利多卡因乳膏，或局部肌注、皮下注射利多卡因、普鲁卡因等药物进行麻醉，通常在激光去疣的过程中不会产生疼痛感。
当病人接受激光去疣治疗时，当麻醉药疗效消失时，病人激光去疣处便有微痛，这时病人可接受局部冷敷治疗，可达到减轻肿胀，减少出血和止痛等效果。如感到疼痛较剧烈时，可与布洛芬等使用镇痛药联合应用。患者在激光去疣之后应该注意对伤口的保护，避免伤口受外界创伤的刺激出现疼痛的情况。
病人激光去疣时可有火烧感和轻微疼痛，可将红霉素软膏敷于患处预防炎症。激光常用于疣体清除，亦可用火针、液氮冷冻和光动力治疗扁平疣和寻常疣。疣一般是由人乳头瘤病毒感染引起的，激光和液氮冷冻虽可除去疣体，但无法除去体内病毒，病人可在手术后选择抗病毒治疗来降低疣复发的风险。