朱砂的急性中毒表现为消化道系统的一系列症状，包括恶心、呕吐、唾液增多、口腔黏膜充血、水肿、坏死、牙龈肿胀、上腹部灼烧感、腹泻、里急后重和脓血便，严重时可能导致消化道穿孔，从而形成腹膜炎。
肾脏损害在中度和轻度中毒后的4~10天内可能出现，若未得到妥善处理，则可能演变为慢性损害，并留下长期的后遗症。重度中毒者多伴有肾功能衰竭及急性肾衰。在病情恶化的情况下，肾脏可能会在1至2天内遭受坏死，导致尿量减少、尿毒症甚至死亡的严重后果。
中重度中毒多伴有神经系统症状。朱砂中毒的心电图呈现出异常的表现，可能导致酸中毒、血压下降以及全身水肿等症状。重度中毒患者多伴有神经系统损害。神经系统的受损表现为头昏眼花、疲乏无力、失眠难眠、全身虚弱，甚至可能导致昏迷、休克等症状。
职业性慢性中毒是朱砂中毒的主要表现形式，其发生率较高。临床上常见到汞斑牙和黄疸型肝炎，还有少数病例可见于其他疾病如高血压症、冠状动脉粥样硬化性心脏病等。