肺部支原体感染主要表现为低热、咳嗽、干咳和夜间发作，病程较长。
在临床上经常会出现肺部支原体感染，导致社区获得性肺炎感染的病原主要有肺炎链球菌、肺炎衣原体、肺炎军团菌等，这些都是非典型病原体。临床上难以发现，临床上常需结合患者的临床表现、血清学的冷凝试验及肺部CT征象等，才能确定是否为肺炎支原体所致。
肺炎支原体的主要症状是低热，体温很少会高于38.5摄氏度，患者还会有咳嗽的症状，主要是以干咳为主要特征，在晚上的时候更是会有严重的咳嗽，并且会有少量的白痰，还有可能会有干咳的症状，而且这些症状多发生在晚上，影像学上还会有肺部间质性的变化。除了支原体导致的肺部感染外，还可能会出现心肌异常、胸腔积液等全身性症状。