孩子咳嗽伴有口腔溃疡可能是呼吸道感染后机体免疫力下降引起口腔黏膜溃疡的结果。如果口腔溃疡反复出现并伴有咳嗽，还需要警惕可能存在的自身免疫性疾病。
1.呼吸道感染：当机体免疫力因受凉、劳累、熬夜、精神紧张等原因下降时，容易受到各种病毒等的侵袭，引起咳嗽症状。免疫受损还会使口腔黏膜容易出现溃疡、口腔疱疹等症状。此时，孩子需适当休息，增加水分摄入。并根据医生的建议，使用四季抗病毒合剂或抗病毒口服液等药物治疗。对于单纯疱疹感染，可以服用阿昔洛韦等抗病毒药物。
2.自身免疫性疾病：例如白塞病、小血管炎等，白塞病的典型症状是反复出现口唇和生殖器溃疡，而且针尖试验结果为阳性。如果口腔溃疡反复出现，并伴有咳嗽症状，需要进行自身免疫性疾病系列或肾脏循环免疫系列的检查，以明确诊断。一旦确诊，需在医生的指导下使用糖皮质激素如泼尼松和免疫抑制剂如硫唑嘌呤等进行治疗，以减轻症状。