脑瘫儿的后遗症主要有中枢性运动功能障碍，体态异常，还可能会伴有认知发育迟缓。
1、中枢性运动功能障碍：新生儿的运动功能不全，随年龄增长，不能做同年龄新生儿能够做的简单动作，不能翻身，不能坐起来，不能站立，不能走路。有些新生儿连最基本的咀嚼、吞咽等基本动作都不能完成。随着年龄的增加，可出现肌肉紧张、运动困难、运动能力下降、运动功能不全等病症。
2、体态异常：新生儿会有多种体态的异常，例如偏侧体态，一侧肢体无力，两侧肢体发育不对称，或肢体肌肉张力显著增加，头向后弯曲等。也有可能会出现舞步般的体态，体态不够稳定，很难维持一个稳定的体态。
3、认知发育迟缓：新生儿的认知能力有显著的缺陷，其智能程度较低，包括计算、逻辑、记忆、认知等，都比同龄人要差。
此外，语言功能也会发展缓慢，主要表现为说话不清楚，说话不利索，不能很好地表达自己的意思。
脑瘫儿的后遗症往往会对新生儿和家庭造成很大的负担，对学习、工作、生活乃至心理都会造成很大的影响。所以，必须要在患病的早期进行积极主动的治疗，并进行长期的、系统性的功能训练。