头晕做核磁共振检查不一定能查出，对实质性病变导致的头晕如脑血管硬化和颅内肿瘤等其他病症可以用核磁共振做出初步诊断，但是低血糖和睡眠不足导致的头晕是不能用核磁共振来诊断的，因此需要根据具体情况来做出分析。
核磁共振可以通过核磁共振现象得到人体器官在不同密度时的结构，这也是一种比较常用的检查方法。当病人为颅内肿瘤，其他脏器良恶性肿瘤，帕金森及脑血管硬化导致眩晕时，在以上情况中，就是可藉由核磁共振检查以清楚眩晕之特定原因。
如果病人因低血糖，睡眠不足或其他非器质性疾病而头晕时，核磁共振检查无法确定原因，通常不优先考虑核磁共振检查。以上情况，可根据有关原因作体征观察，血液生化及其他检查以协助确诊头晕原因。