脂肪吸收过程中，任意环节发生障碍，均可引起吸收不良导致腹泻，较多见于各种梗阻性黄疸，包括先天性胆道梗阻以及感染中毒性肝炎等。由于此类患儿肠胃缺乏胆汁，脂肪不能够被乳化。其次，见于肠道疾病如各种肠道感染、局限性回肠炎、溃疡性结肠炎、乳糜性肠瘘、肠管大部分切除以及肠道淋巴梗阻。因缺乏胰酶所导致的脂肪泻见于先天性囊性纤维变，代谢异常以及其他原因引起的肠吸收不良综合征，也可以引起脂肪泻。