支原体目前临床症状主要看它感染的部位，支原体分为呼吸道的、肺炎支原体，也可以有其他的如泌尿道的、解脲支原体、人型支原体。不同的支原体感染不同的部位，临床症状也不一样。支原体阳性的主要表现为咳嗽、咳痰，支原体感染时咳嗽性质与细菌感染不同，通常表现为剧烈的刺激性呛咳，持续时间较长，咳出少量白色痰液，多伴有发热、头痛、咽痛等症状。全身症状可以表现为乏力、肌肉酸痛等。