对于已经确诊乳腺癌，不管是经过手术还是没有经过手术，都要进行临床的分期以及乳腺肿瘤的细胞学分级、分子分型等等，以备将来需要全身的综合治疗。乳腺的恶性肿瘤并不是一个局部疾病，手术本身不全能将肿瘤治愈，因此还需要全身的综合治疗。
细胞分级比较高，以及分子分型不好，比如三阴性的或者是合图阳性的病人，还有就是临床分期比较晚，比如淋巴结有转移的病人，这些病人未来发生复发、转移的风险比较高，也就是说可能在做手术的时候，已经存在转移到全身其他部位的亚临床病灶，亚临床病灶不是靠手术就能去掉，因此就需要进行化疗。化疗是一种全身治疗，将化疗药物输入到全身，然后就可以将潜在的亚临床病灶杀灭，对有化疗指征的人采取化疗以后，可以明显的提高远期的生存率。