手术过程中需要保护好喉返神经和喉上神经，避免出现暂时或永久的声音嘶哑或丧失声音以及饮水呛咳等情况。需要注意保护好甲状旁腺，它有助于调节血钙水平。误切除后可能导致低血钙，出现肌肉痉挛和麻木刺痛的感觉。颈部血管比较多，术中需要仔细确切的止血。伤口必须放置引流管，术后负压吸引，以免血肿压迫发生呼吸道梗阻。术中如损伤胸膜引起气胸，应放置胸腔闭式引流管。甲状腺癌根治术，是一种无菌性手术，所以手术过程中需要强调无菌操作，避免手术过程中术区污染导致感染。手术过程中，需要根据疾病的具体分期，选择甲状腺切除的范围，以及是否进行淋巴结清扫。