口腔囊肿分为牙源性和非牙源性囊肿。牙源性囊肿中，根尖囊肿是由于口腔内牙齿长期存在慢性炎症，引起牙周膜内的上皮增生、周围组织液不断渗出而形成囊肿。始基囊肿、含牙囊肿、角化囊肿等都是由于牙齿在发育过程中受到刺激后，出现液体渗出而形成的。非牙源性囊肿主要是由牙胚发育过程中残留的上皮剩余发展而来，属于良性病变，包括鼻唇囊肿、正中囊肿等。