伽玛刀治疗三叉神经痛可能会出现面部的长时间的麻木、咀嚼肌无力、角膜反射减弱、角膜干燥甚至角膜溃疡出现失明等后遗症。伽玛刀治疗三叉神经痛是通过放射射线对三叉神经半月节内的神经根进行照射，使其出现坏死，感觉丧失，从而达到消除三叉神经痛的目的。一方面可以使疼痛消失，另一方面使三叉神经其它的分支包括运动支出现损伤，从而导致上述并发症。