输尿管肿瘤的最佳治疗方法有：1.输尿管良性肿瘤，如输尿管息肉、输尿管良性乳头状瘤等，最好的治疗方法是进行微创手术治疗，如经尿道输尿管镜下输尿管息肉激光切除术等。2.输尿管恶性肿瘤，如输尿管移行细胞癌等，最好的治疗方案是行腹腔镜下输尿管癌根治术，切除患侧肾脏、输尿管全长，以及输尿管开口处的部分膀胱壁，术后行规律膀胱灌注化疗和定期膀胱镜检查。