早期胸腺癌治愈率可达到90%以上，而对于中晚期的胸腺癌，治愈率仅为30%左右。胸腺癌早期尚未发生淋巴结转移以及远处转移，因此可以通过根治性手术切除而达到完全治愈，部分患者会在术后五年内复发。
胸腺癌中晚期不能仅靠单一手术切除治疗，还需要辅助放射治疗以及化学药物治疗，肿瘤不容易被完全消灭，导致治愈率较低。