直肠癌术后两年左右有一个复发的高峰，80%的复发在术后五年内，治疗不规范容易复发。影响复发还有一些客观因素，比如肿瘤分期、组织分级、免疫特性、病人的身体状况等，分期早晚对预后影响要更大一些。
在初诊结直肠癌病例中，有20%的患者会出现疾病转移。另外，还有25%局限性疾病的患者后期也会发生转移。转移性结直肠癌定义为转移性疾病，或扩散到原结直肠癌肿块之外的癌症，最常见的转移部位为淋巴结、肝脏、肺和腹膜。