1、病理检查：是确诊的必须检查，有腹痛、腹块，CT检查或内窥镜检查提示有占位性病变，可行剖腹探查术，术中快速冰冻切片检查，即可明确诊断，又可争取切除。也可以内窥镜下大块多点活检，并在同一部位重复，除取出黏膜外，有必要钳取黏膜下组织活检。
2、内窥镜检查：对诊断大肠恶性淋巴瘤有很重要的价值，具有快速、方便、直观、可及时行活检取材等优点。
3、骨髓穿刺活检：主要是评估肿瘤是否发生骨髓侵犯。
4、实验室检查：血常规、血沉、生化，主要用于辅助诊断、评估疗效以及监测病情变化，乳酸脱氢酶(LDH)必查。
5、影像学检查：PET-CT(全身肿瘤断层显像)检查：可确定病情分期。
6、颅脑MR检查：主要是评估肿瘤是否发生脑部转移。
7、胸腹部超声、加强CT、MR检查：主要是评估肿瘤的部位、侵犯范围，是否发生肝脏、脾脏等部位的侵犯转移。