1、钡剂灌肠或气钡双重对比灌肠：钡剂灌肠或气钡双重对比灌肠能较清晰显示肿瘤，钡灌肠可见肠腔内有一圆形或卵圆形充盈缺损，切线位投照时肿瘤较周围组织密度低，表面光滑。当肿瘤带蒂时以粗短蒂与肠壁相连，无蒂者呈半圆形突入腔内。由于脂肪瘤质软，在检查过程中施压可使充盈缺损的形态随压力而有所改变。此外，灌肠可见袖套征。
2、腹部CT：腹部CT不仅能确定病变部位、大小，而且能明确病变性质，是确诊脂肪瘤的可靠检查方法，脂肪瘤的CT表现为形态规则的低密度块影。
3、结肠镜检查：结肠镜检查可直接看到黏膜下层脂肪瘤，用活检钳按压可使呈锯齿状，放松后即恢复原状。同一处反复活检，去除表面黏膜，脂肪可突出，瘤体活检病理证实为脂肪组织。上述特征性的内镜表现可明确结肠脂肪瘤，特别是黏膜下脂肪瘤的诊断。
4、术中探查：术中探查对明确诊断也很重要，位于肠腔内的脂肪瘤通过肠壁可扪及光滑、质偏软、活动度较明显、界限较清楚、肠浆膜正常等表现。沿结肠带切开肠腔，见肿物位于黏膜下，多为卵圆型，有蒂，呈息肉状，当肿物切下剖面呈黄白色外观，冰冻切片即可明确诊断。