目前由于机制不明，胰多肽瘤的最佳疗方案仍为外科手术切除。切除范围标准以能达到根治为标准，可根据术前评估采取不同手术方式，辅助化疗、放疗。本病的治疗周期较长，一般是长期间歇性治疗。
一、一般治疗
注意营养，不能进食者，给予胃肠外营养，有梗阻性黄疸者应查明梗阻部位给予相应治疗措施，纠正患者贫血和低蛋白血症以改善患者的状况。
二、药物治疗
1、靶向治疗：常用药物为贝伐珠单抗、舒尼替尼、依维莫司等，主要作用是延长本病的生存时间。
2、生长抑素类似物：如奥曲肽，可以控制胰多肽瘤腹痛、腹泻的症状。
三、手术治疗
外科手术是本病的首选治疗方法，尤其是对于早期、孤立性的肿瘤，应争取手术切除。位于胰体、尾部的肿瘤，呈孤立性的表浅病灶，可行肿瘤剂除术；位置深在或呈多发性者，则行胰体、尾部切除术。胰头部肿瘤，可行80%的胰切除加肿瘤切除；如果瘤体较大，单纯胰腺切除较困难者，亦可行胰十二指肠切除术。对于肿瘤体积大，病程较晚或已有转移的患者，行肿瘤减容术也能起到缓解作用。
四、放射治疗
选择性内放射治疗：腹部局部放射，其作用为通过放射线杀伤肿瘤细胞，抑制肿瘤的增殖、生长。
五、化学药物治疗
对于晚期肿瘤病人，可行化学治疗，药物以链脲霉素为首选。有人应用链脲霉素治疗2例胰多肽瘤病人，其中1例存活3年半。醋酸奥曲肽能广泛地抑制功能性内分泌肿瘤分泌胰多肽，有效率可达90%。化学疗法可使症状缓解或部分缓解，血清胰多肽下降，甚至恢复正常。
六、其他治疗
1、射频消融：对于减缓胰多肽瘤的生长有一定作用，主要是通过热量使肿瘤细胞坏死。
2、动脉栓塞疗法：对于不能手术的患者可以考虑此方法，可以减缓肿瘤的增长，延长生存时间。