阴囊湿疹样癌的病因尚不明确，目前临床推测该病的病因可能与表皮基底层干细胞来源有关，或来自于表皮内腺管，好发于50~60岁的老年人，或与职业接触致癌物有关。
阴囊湿疹样癌目前病因尚不明确，目前临床上有三种推测，或来源于表皮自身，可能与表皮基底层原始干细胞有关，或来源于表皮内腺管，少数肿瘤可能来自于相邻器官。