腺肌症月经过后肚子疼可通过以下方式进行处理：
腺肌症的女性月经过后如果肚子疼，可以到妇科做盆腔彩超，也可以做宫腹腔镜下联合检查。如果是妇科炎症所致，可以选择适当的抗生素药物进行治疗，还可以配合理疗来改善症状，一般疗效比较好。如果是因为泌尿系统结石所致，可以根据结石的具体情况选择适合自己的方式进行治疗。