慢性牙周炎的治疗需要通过全面清除菌斑、牙石等病原刺激物，以消除牙龈炎症，使牙周袋变浅，并改善牙周附着水平，因此需要根据病情选择相应的治疗方案，包括一般治疗、药物治疗和手术治疗等。
1、治疗慢性牙周炎的有效手段在于消除致病因素，从而实现对大多数患者的控制。用碘仿纱条填塞以减轻炎症反应并促进其愈合，最后用牙贴膏固定或粘接修复患牙。通过进行口腔清洁手术，清除牙龈上和牙龈下的牙石，同时进行根面平整术，以刮除那些暴露在牙周内含有大量内毒素的病变牙骨质。这样的做法有助于促进根面上牙周支持组织的再生，从而保护牙周组织的完整性；
2、药物疗法可选用甲硝唑、替硝唑、阿莫西林等药物，但仅限于作为辅助治疗措施。对于患有一系列系统性疾病，如糖尿病、贫血等的慢性牙周炎患者，积极治疗炎症、控制全身疾病，有助于促进牙周组织的康复；
3、针对不同的病情，建议在进行牙周基础治疗后6-8周进行复查，若发现仍有≥5mm的牙周袋残留，且探诊时仍有出血，或某些部位的牙石难以完全清除，此时可以考虑进行牙周翻瓣手术。