使用下列药物进行口腔消毒效果更佳，比如碘伏、过氧化氢溶液、氯己定溶液、碘甘油、西吡氯铵含漱液等。
1、碘伏，作为一种消毒剂，具有较低的毒性、相对较高的安全性、较低的刺激性和安全性。目前，该方法已被广泛应用于口腔黏膜表面的消毒，并可置于脓肿引流后的牙周袋内，具有显著的消炎功效。在手术前和脓肿引流前施用，可获得出色的消毒效果。在出现黏膜着色的情况下，亦可采用酒精进行擦除处理。
2、对于厌氧菌而言，过氧化氢溶液展现出了卓越的抑制能力。在进行超声波洁治之前，建议患者漱口过氧化氢，这样可以显著减少喷雾中细菌的数量，从而避免交叉感染的发生。
3、氯己定溶液，作为一种广谱抗菌剂，表现出对多种革兰氏阳性和阴性细菌的高效抗菌特性。有效地清除或减少口腔内微生物的繁殖，同时抑制龈上菌斑的堆积，从而避免致病菌在牙面和牙周袋内重新生长，有效预防牙龈炎症的再次发作。
4、碘甘油因其具有一定的抗菌、消炎和收敛特性，可有效促进牙龈炎的康复，同时也是口腔消毒的理想选择。
5、西吡氯铵含漱液：西吡氯铵作为一种广谱抗菌剂，具有抑制菌斑形成、减少口腔炎症等多种功效，同时还能有效地发挥消毒作用。