在根管治疗过程中，常常会出现一系列后遗症，包括诱发炎症感染、影响口腔美观以及缩短牙齿的使用寿命等问题。
1.如果根管治疗不彻底或手术后未注意口腔卫生，可能会导致炎症感染，引起疼痛，严重时甚至可能导致慢性根尖炎症、残髓炎和根尖囊肿的发生。
2.在进行牙根管治疗后，由于牙神经的缺失，门牙等牙齿的色泽可能会变得黯淡无光，这会对口腔美观产生负面影响。为了保护牙齿，可以采用包裹烤瓷牙套的方法，同时也可以恢复牙齿的色泽和形态。
3.治疗根管后，由于失去了牙髓的营养支持，牙齿的脆弱性会显著增加，最常见的后遗症是牙齿的折裂或牙根的折裂，这种情况相当严重，会缩短牙齿的寿命。另外一个原因就是根尖周组织对外界刺激敏感。