口腔正常菌群是与宿主在共进化的过程中形成的，它们与宿主之间有着非常强烈的共生关系。按照严重程度，口腔菌群可以被划分为三度，其表现也有一定的区别。
在正常状态下，口腔菌群处于生态平衡状态。但是，如果存在一些不良因素，比如滥用抗生素，那么就会导致口腔菌群失调。
如果为I度口腔菌群失调，病人一般没有什么症状，只是因为口腔内的细菌数量比较多，所以不需要特别的治疗，只要注意口腔卫生，病人就会恢复正常。
但是若为II度口腔微生物群落失调，以免疫功能下降为主要症状，易引起口腔疾病，例如口腔疱疹性咽峡炎，口腔白色念珠菌感染炎等。可能会出现口腔局部粘膜红肿、溃烂、疼痛等症状，有的人还会有口腔异味。