口腔上颚溃疡的发生与多种因素有关，包括但不限于饮食不当、局部损伤、营养缺乏、机体免疫力下降以及病毒感染等，因此在治疗过程中，必须先查明病因，然后采取一般治疗、营养治疗和免疫治疗等综合措施。对于持续不缓解的溃疡，建议患者及时就医，并在医生的指导下进行处理。
针对口腔上颚黏膜损伤所致的溃疡，通常采用含有消炎成分的含漱液、含片等药物进行治疗，如氯己定含漱液、复方硼砂含漱液、西地碘含片、地喹氯铵含片等，同时也可以使用西瓜霜喷剂、草珊瑚口腔喷雾剂等，以促进症状的改善；
针对口腔溃疡因营养缺乏而引起的问题，可考虑补充维生素B、维生素C以及微量元素，以促进口腔黏膜的修复和溃疡症状的改善。