根管治疗后牙齿仍然疼痛的原因可能有以下几点：
1.牙周组织存在炎症，表现为牙周红肿、牙齿松动等。这可能是由于根管治疗后出现了牙周炎。应进行牙周治疗，冲洗消炎。
2.根管治疗可能有遗漏，未能完全清除牙髓组织，残留的牙髓组织持续感染，引起疼痛。这需要进行根管再治疗，彻底清除残留牙髓。
3.根尖组织未完全消炎，持续炎症刺激牙齿神经，导致疼痛感。需要再次根管治疗，完全消除根尖炎症。
4.治疗后牙髓失去血液供应，牙体脆性增大。如果咀嚼过硬食物，可能导致牙体破裂，出现疼痛。需拔除患牙，后期修复。
综上所述，根管治疗后牙齿仍疼痛的原因可能有牙周组织炎症、根管治疗不完全、根尖组织未消炎以及咀嚼不当引起牙体破裂等，需要针对病因进行针对性的治疗，才能彻底消除疼痛。