碘伏不适用于口腔溃疡的治疗，因为口腔溃疡不是细菌感染，而是局灶性的炎症，属于炎症性的反应。因此，用碘伏消毒口腔溃疡并没有帮助。
口腔溃疡的治疗原则是消炎、止疼、促进溃疡愈合。由于口腔溃疡的炎症是免疫性相关炎症，选择糖皮质激素的比较多，比如用曲安奈德口腔膏或者是促进上皮愈合的比较多。碘伏刺激性比较明显，不太主张直接的就用抗菌的局部治疗，建议选用中药或者是局部有促进愈合作用的药物，更加妥当。
如果想用抗菌作用的药物，可以选用西地碘含片。另外，患者切勿自行服药，具体用药请结合临床，由医生面诊指导为准。