腱鞘囊肿若无明显症状，无需特殊处理，并注重休息，忌久站久走，忌手指、手腕用得太多，同时切忌重复揉搓按摩，部分腱鞘囊肿可消失，约三至四周。对于较大的腱鞘炎性囊肿可采用局部药物注射和切开引流的方法来达到治愈的目的。若腱鞘囊肿渐大，手术切除可考虑。
此外，腱鞘囊肿患者应该注意避免摩擦患处，以免加重病症，不利于腱鞘囊肿恢复。