封闭针剂注射3日后出现的疼痛主要是以下因素：
1.由于封闭针剂的位置与受伤位置有偏差，造成了正常的组织损害，并使局部肿胀加剧。
2.针尖在关节腔内注入时，会对关节的滑膜和关节的软骨造成伤害，使患者出现肿胀、流血等情况。
3.在注射过程中，由于局部的血管受损而出现大出血，从而引起血肿的刺激，从而引起神经末梢的疼痛。
4.在给药后病人进行激烈的活动，使局部的伤害增加，从而引起痛苦。